這個過程就是水的自我凈化。所謂自凈，是指有機污染物被氧化成無機物的過程。水中有各種各樣的植物、微生物、魚類和其他生物。這些生物可以在自身的生長繁殖過程中利用有機物質，這樣一來，污染物就變得穩定，有害的無機物也變少了。排入河水的污染物首先被細菌、真菌等微生物作為營養物質吸收，分解利用。

細菌、真菌被原生動物吞食，氮、磷等無機污染物被藻類吸收。藻類通過光合作用產生氧氣，被水體中的其他生物用于呼吸。然而，如果營養元素過量，水中的藻類會瘋狂生長，再次污染。當然，如果河水中有魚、鴨等生物活動，它們可以利用水中的藻類作為食物來抑制過量的藻類。

總之，水中污染物的濃度按照食物鏈由低到高逐漸降低。